MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002679	CAC	3	9	250029	250037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488278
4002	NC_002679	CAT	2	6	250052	250057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488278
4003	NC_002679	TCC	2	6	250201	250206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488278
4004	NC_002679	TGA	2	6	250240	250245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488278
4005	NC_002679	CGT	2	6	250262	250267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
4006	NC_002679	GC	3	6	250287	250292	0 %	0 %	50 %	50 %	13488278
4007	NC_002679	AGA	2	6	250321	250326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488279
4008	NC_002679	TGC	2	6	250378	250383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4009	NC_002679	CGG	2	6	250390	250395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488279
4010	NC_002679	CGC	2	6	250399	250404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
4011	NC_002679	GCC	2	6	250454	250459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
4012	NC_002679	CTTCGG	2	12	250460	250471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4013	NC_002679	CGA	2	6	250499	250504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4014	NC_002679	TTA	2	6	250532	250537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488279
4015	NC_002679	TCG	2	6	250591	250596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4016	NC_002679	GCC	2	6	250617	250622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488279
4017	NC_002679	TGC	2	6	250654	250659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4018	NC_002679	TCG	2	6	250693	250698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4019	NC_002679	TTC	2	6	250716	250721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488279
4020	NC_002679	GTC	2	6	250740	250745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488279
4021	NC_002679	ATGG	2	8	250762	250769	25 %	25 %	50 %	0 %	13488279
4022	NC_002679	CG	3	6	250778	250783	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
4023	NC_002679	CG	3	6	250787	250792	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
4024	NC_002679	GC	3	6	250813	250818	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
4025	NC_002679	ATCT	2	8	250866	250873	25 %	50 %	0 %	25 %	13488279
4026	NC_002679	CTT	2	6	250905	250910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488279
4027	NC_002679	TCCT	2	8	250962	250969	0 %	50 %	0 %	50 %	13488279
4028	NC_002679	CG	4	8	251038	251045	0 %	0 %	50 %	50 %	13488279
4029	NC_002679	CATCGT	2	12	251069	251080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13488279
4030	NC_002679	GCCGTC	2	12	251088	251099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488279
4031	NC_002679	A	6	6	251169	251174	100 %	0 %	0 %	0 %	13488280
4032	NC_002679	TTG	2	6	251188	251193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488280
4033	NC_002679	CGC	2	6	251277	251282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
4034	NC_002679	CGA	2	6	251323	251328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488280
4035	NC_002679	CTG	2	6	251418	251423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
4036	NC_002679	CGA	2	6	251428	251433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488280
4037	NC_002679	CAGG	2	8	251447	251454	25 %	0 %	50 %	25 %	13488280
4038	NC_002679	GCT	2	6	251469	251474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
4039	NC_002679	TGG	2	6	251526	251531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488280
4040	NC_002679	GGC	2	6	251588	251593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
4041	NC_002679	TGC	2	6	251666	251671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488280
4042	NC_002679	CGG	2	6	251675	251680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
4043	NC_002679	CG	3	6	251727	251732	0 %	0 %	50 %	50 %	13488280
4044	NC_002679	CTTG	2	8	251741	251748	0 %	50 %	25 %	25 %	13488280
4045	NC_002679	GCC	2	6	251759	251764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
4046	NC_002679	CGG	2	6	251830	251835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
4047	NC_002679	CAT	2	6	251981	251986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488280
4048	NC_002679	GCC	2	6	252039	252044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488280
4049	NC_002679	ACC	2	6	252103	252108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488280
4050	NC_002679	TTCG	2	8	252164	252171	0 %	50 %	25 %	25 %	13488280
4051	NC_002679	CCGG	2	8	252245	252252	0 %	0 %	50 %	50 %	13488280
4052	NC_002679	GAT	2	6	252264	252269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488280
4053	NC_002679	GGC	2	6	252291	252296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
4054	NC_002679	GGC	2	6	252317	252322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488280
4055	NC_002679	AGA	2	6	252404	252409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488280
4056	NC_002679	CG	3	6	252496	252501	0 %	0 %	50 %	50 %	13488281
4057	NC_002679	TG	3	6	252505	252510	0 %	50 %	50 %	0 %	13488281
4058	NC_002679	TAG	2	6	252522	252527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488281
4059	NC_002679	CTG	2	6	252620	252625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
4060	NC_002679	TGC	2	6	252706	252711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
4061	NC_002679	GCT	2	6	252733	252738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
4062	NC_002679	ACG	2	6	252752	252757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
4063	NC_002679	ATG	2	6	252819	252824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488281
4064	NC_002679	GCGA	2	8	252847	252854	25 %	0 %	50 %	25 %	13488281
4065	NC_002679	TCT	2	6	252859	252864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488281
4066	NC_002679	TCG	2	6	252924	252929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
4067	NC_002679	TCA	2	6	252960	252965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488281
4068	NC_002679	ATG	2	6	252968	252973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488281
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4070	NC_002679	AAG	2	6	253034	253039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488281
4071	NC_002679	GAG	2	6	253058	253063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488281
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4074	NC_002679	CGA	2	6	253128	253133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
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4076	NC_002679	CGA	2	6	253201	253206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488281
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4079	NC_002679	CAT	2	6	253309	253314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488281
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4084	NC_002679	TCG	2	6	253560	253565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488281
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4087	NC_002679	TGG	2	6	253832	253837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488282
4088	NC_002679	CAA	2	6	253934	253939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488282
4089	NC_002679	GGC	2	6	253955	253960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488282
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4092	NC_002679	GGT	2	6	254015	254020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488282
4093	NC_002679	CGG	2	6	254049	254054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488282
4094	NC_002679	A	6	6	254059	254064	100 %	0 %	0 %	0 %	13488282
4095	NC_002679	GGC	2	6	254072	254077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488282
4096	NC_002679	CCA	2	6	254080	254085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488282
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4100	NC_002679	CG	3	6	254231	254236	0 %	0 %	50 %	50 %	13488283
4101	NC_002679	CGC	2	6	254295	254300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488283
4102	NC_002679	CTGGC	2	10	254357	254366	0 %	20 %	40 %	40 %	13488283
4103	NC_002679	GGC	2	6	254377	254382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488283
4104	NC_002679	TCG	2	6	254493	254498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488283
4105	NC_002679	ATC	2	6	254546	254551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488283
4106	NC_002679	ACC	2	6	254582	254587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488283
4107	NC_002679	CGG	2	6	254629	254634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488283
4108	NC_002679	CG	3	6	254685	254690	0 %	0 %	50 %	50 %	13488283
4109	NC_002679	TGG	2	6	254724	254729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488283
4110	NC_002679	TGA	2	6	254907	254912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488284
4111	NC_002679	CGC	2	6	254941	254946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488284
4112	NC_002679	CTG	2	6	254993	254998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488284
4113	NC_002679	CAC	2	6	255010	255015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488284
4114	NC_002679	CCG	2	6	255067	255072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488284
4115	NC_002679	GGC	2	6	255104	255109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488284
4116	NC_002679	GCT	2	6	255145	255150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488284
4117	NC_002679	CGC	2	6	255163	255168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488284
4118	NC_002679	CAGG	2	8	255188	255195	25 %	0 %	50 %	25 %	13488284
4119	NC_002679	GCC	2	6	255200	255205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488284
4120	NC_002679	CGA	2	6	255277	255282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488284
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4122	NC_002679	GC	3	6	255362	255367	0 %	0 %	50 %	50 %	13488284
4123	NC_002679	CGA	2	6	255370	255375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488284
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4240	NC_002679	CG	3	6	259972	259977	0 %	0 %	50 %	50 %	13488134
4241	NC_002679	CAG	2	6	260014	260019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488134
4242	NC_002679	CAA	2	6	260264	260269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488290
4243	NC_002679	CTC	2	6	260300	260305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488290
4244	NC_002679	CCA	2	6	260309	260314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488290
4245	NC_002679	GGC	2	6	260377	260382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488290
4246	NC_002679	GAC	2	6	260427	260432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488290
4247	NC_002679	TC	3	6	260493	260498	0 %	50 %	0 %	50 %	13488290
4248	NC_002679	GCC	2	6	260503	260508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488290
4249	NC_002679	GCT	2	6	260589	260594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488290
4250	NC_002679	ATCG	2	8	260659	260666	25 %	25 %	25 %	25 %	13488290
4251	NC_002679	GCG	2	6	260712	260717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488290
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4253	NC_002679	CAC	2	6	260852	260857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488290
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4258	NC_002679	TGC	2	6	261020	261025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488290
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4260	NC_002679	TGCA	2	8	261113	261120	25 %	25 %	25 %	25 %	13488290
4261	NC_002679	CAA	2	6	261198	261203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488290
4262	NC_002679	TCA	2	6	261353	261358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488290
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4265	NC_002679	CAAGG	2	10	261627	261636	40 %	0 %	40 %	20 %	13488290
4266	NC_002679	TGA	2	6	261648	261653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488290
4267	NC_002679	TCAG	2	8	261749	261756	25 %	25 %	25 %	25 %	13488290
4268	NC_002679	TTA	2	6	261825	261830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488290
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4274	NC_002679	TC	3	6	262071	262076	0 %	50 %	0 %	50 %	13488290
4275	NC_002679	CTG	2	6	262091	262096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488290
4276	NC_002679	TGC	2	6	262113	262118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488290
4277	NC_002679	GTTC	2	8	262125	262132	0 %	50 %	25 %	25 %	13488290
4278	NC_002679	GAGCA	2	10	262192	262201	40 %	0 %	40 %	20 %	13488290
4279	NC_002679	CAA	2	6	262254	262259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488290
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4283	NC_002679	CTGT	2	8	262705	262712	0 %	50 %	25 %	25 %	13488333
4284	NC_002679	ACT	2	6	262930	262935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488135
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4287	NC_002679	CG	3	6	263082	263087	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
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4289	NC_002679	TCGT	2	8	263204	263211	0 %	50 %	25 %	25 %	13488135
4290	NC_002679	GC	5	10	263316	263325	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
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4295	NC_002679	TCA	2	6	263461	263466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488135
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4298	NC_002679	CG	3	6	263857	263862	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
4299	NC_002679	TGA	2	6	263876	263881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488135
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4302	NC_002679	CGA	2	6	264013	264018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488135
4303	NC_002679	ATGT	2	8	264029	264036	25 %	50 %	25 %	0 %	13488135
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4321	NC_002679	AT	3	6	264792	264797	50 %	50 %	0 %	0 %	13488135
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4324	NC_002679	CGC	2	6	264869	264874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488135
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4328	NC_002679	CG	3	6	264964	264969	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
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4335	NC_002679	CAG	2	6	265216	265221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488136
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4339	NC_002679	CGC	2	6	265414	265419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488136
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4345	NC_002679	CGAC	2	8	266155	266162	25 %	0 %	25 %	50 %	13488291
4346	NC_002679	ATCG	2	8	266169	266176	25 %	25 %	25 %	25 %	13488291
4347	NC_002679	CTG	3	9	266202	266210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488291
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4350	NC_002679	CGCT	2	8	266337	266344	0 %	25 %	25 %	50 %	13488291
4351	NC_002679	TGC	2	6	266440	266445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488291
4352	NC_002679	CCG	2	6	266512	266517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488291
4353	NC_002679	CCG	2	6	266587	266592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488291
4354	NC_002679	ATC	2	6	266595	266600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488291
4355	NC_002679	C	6	6	266620	266625	0 %	0 %	0 %	100 %	13488291
4356	NC_002679	GCTGCC	2	12	266659	266670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488292
4357	NC_002679	GAT	2	6	266696	266701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488292
4358	NC_002679	AGC	2	6	266763	266768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488292
4359	NC_002679	CTG	2	6	266784	266789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488292
4360	NC_002679	CGG	2	6	266827	266832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488292
4361	NC_002679	GAT	2	6	266869	266874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488292
4362	NC_002679	GC	4	8	266892	266899	0 %	0 %	50 %	50 %	13488292
4363	NC_002679	AAC	2	6	266905	266910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488292
4364	NC_002679	AGG	2	6	266916	266921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488292
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4366	NC_002679	GC	3	6	267240	267245	0 %	0 %	50 %	50 %	13488293
4367	NC_002679	TCGA	2	8	267258	267265	25 %	25 %	25 %	25 %	13488293
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4369	NC_002679	CCG	2	6	267296	267301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488293
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4492	NC_002679	GCA	2	6	274867	274872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488340
4493	NC_002679	CCG	2	6	274875	274880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488340
4494	NC_002679	TGCCA	2	10	274949	274958	20 %	20 %	20 %	40 %	13488340
4495	NC_002679	GCT	3	9	275006	275014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488340
4496	NC_002679	CCG	2	6	275039	275044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488340
4497	NC_002679	ACG	2	6	275134	275139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488362
4498	NC_002679	GCC	2	6	275232	275237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488362
4499	NC_002679	CGT	2	6	275264	275269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488362
4500	NC_002679	TCAAGG	2	12	275284	275295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13488362

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